Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms