Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

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Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PKD1P98161 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PKD1P98161 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PKD1P98161 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PKD1P98161 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PKD1P98161 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PKD1P98161 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PKD1P98161 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PKD1P98161 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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