Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO4P61968 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO4P61968 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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