Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VBP1P61758 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms