Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms