Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPTEP56180 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPTEP56180 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPTEP56180 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms