Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms