Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATN1P54259 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATN1P54259 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATN1P54259 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATN1P54259 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATN1P54259 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATN1P54259 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATN1P54259 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms