Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms