Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms