Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms