Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPIAP49247 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPIAP49247 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPIAP49247 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPIAP49247 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms