Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms