Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRXP46100 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRXP46100 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms