Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRATP43155 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRATP43155 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRATP43155 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms