Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms