Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC19A1P41440 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms