Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJC1P36383 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms