Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms