Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
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