Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD27P26842 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD27P26842 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD27P26842 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms