Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PLNP26678 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PLNP26678 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms