Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTX3P26022 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTX3P26022 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms