Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSSP25774 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSSP25774 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTSSP25774 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTSSP25774 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTSSP25774 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTSSP25774 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTSSP25774 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTSSP25774 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTSSP25774 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTSSP25774 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms