Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
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