Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBTFP17480 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
UBTFP17480 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBTFP17480 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBTFP17480 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBTFP17480 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBTFP17480 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBTFP17480 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBTFP17480 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms