Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRF1P14222 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRF1P14222 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms