Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFTRP13569 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFTRP13569 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CFTRP13569 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFTRP13569 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFTRP13569 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFTRP13569 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFTRP13569 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFTRP13569 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFTRP13569 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CFTRP13569 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CFTRP13569 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CFTRP13569 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms