Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms