Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD1P0DJD0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms