Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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