Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC175P0C221 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms