Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms