Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms