Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNSO60931 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNSO60931 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNSO60931 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNSO60931 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNSO60931 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms