Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTIPO60759 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYTIPO60759 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYTIPO60759 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms