Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLX3O43711 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLX3O43711 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms