Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENRO43583 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENRO43583 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENRO43583 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENRO43583 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENRO43583 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENRO43583 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENRO43583 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENRO43583 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENRO43583 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENRO43583 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENRO43583 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms