Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF208O43345 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms