Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms