Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBDO15205 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBDO15205 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBDO15205 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBDO15205 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBDO15205 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBDO15205 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBDO15205 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBDO15205 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBDO15205 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBDO15205 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms