Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNMO15061 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNMO15061 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNMO15061 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNMO15061 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNMO15061 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNMO15061 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNMO15061 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNMO15061 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNMO15061 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNMO15061 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms