Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS6O14544 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms