Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIEO00221 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms