Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms