Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WIPF3A6NGB9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms