Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIT2A6NDA9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms