Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSDA5PKW4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSDA5PKW4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms