Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMX2A2RU54 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms