Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX9Q9Y5X1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms